許多蛋白質(zhì)可用作治療糖尿病,癌癥和關節(jié)炎等疾病的藥物。合成這些蛋白質(zhì)的人工版本是一個耗時的過程,需要對微生物或其他細胞進行基因工程以產(chǎn)生所需的蛋白質(zhì)。
麻省理工學院的化學家已經(jīng)設計出一種協(xié)議,可以大大減少生成合成蛋白所需的時間。他們的臺式自動流合成機可以在數(shù)小時內(nèi)將數(shù)百種氨基酸(蛋白質(zhì)的組成部分)串在一起。研究人員認為,他們的新技術可以加快按需療法的生產(chǎn)和新藥的開發(fā),并使科學家能夠通過摻入細胞中不存在的氨基酸來設計人工蛋白質(zhì)。
麻省理工學院化學副教授布拉德·彭特洛特(Brad Pentelute)說:“您可以設計出具有卓越生物學功能的新變體,方法是使用非天然氨基酸或專門的修飾來實現(xiàn),而這些修飾是您使用自然界的儀器制造蛋白質(zhì)時無法實現(xiàn)的。”研究的資深作者。
在《科學》雜志上今天發(fā)表的一篇論文中,研究人員表明,它們可以化學產(chǎn)生多條最長不超過164個氨基酸的蛋白質(zhì)鏈,包括酶和生長因子。對于這些合成蛋白中的少數(shù)幾個,他們進行了詳細的分析,表明其功能與天然存在的同類蛋白相當。
該論文的主要作者是前麻省理工學院的博士后Nina Hartrampf,他現(xiàn)在是蘇黎世大學的助理教授,麻省理工學院的研究生Azin Saebi和前麻省理工學院的技術助理Mackenzie Poskus。
快速生產(chǎn)
人體中發(fā)現(xiàn)的大多數(shù)蛋白質(zhì)最長可達400個氨基酸。合成大量這些蛋白質(zhì)需要將所需蛋白質(zhì)的基因傳遞到充當活工廠的細胞中。此過程用于對細菌或酵母細胞進行編程,以產(chǎn)生胰島素和其他藥物,例如生長激素。
“這是一個非常耗時的過程,” Novo Nordisk研究化學負責人托馬斯·尼爾森(Thomas Nielsen)說,他也是該研究的作者。“首先,您需要可用的基因,并且您需要了解有關該生物的細胞生物學的知識,以便您可以設計蛋白質(zhì)的表達。”
蛋白質(zhì)生產(chǎn)的另一種方法是由布魯斯·梅里菲爾德(Bruce Merrifield)于1960年代首次提出的,他的固相肽合成研究后來獲得了諾貝爾化學獎,該方法是逐步將氨基酸化學串在一起。它有20個氨基酸的活細胞用于構建蛋白質(zhì),并使用由梅里菲爾德開創(chuàng)的技術,它需要約一小時以進行化學反應,以氨基添加一個所需酸的肽鏈。
近年來,Pentelute的實驗室基于一種稱為流化學的技術,發(fā)明了一種執(zhí)行這些反應的更快速的方法。在他們的機器中,使用機械泵和閥門將化學品混合,并且在整個合成的每個步驟中,它們都循環(huán)通過一個裝有樹脂床的加熱反應器。在優(yōu)化的方案中,形成每個肽鍵平均需要2.5分鐘,最長25個氨基酸長的肽可以在不到一個小時的時間內(nèi)完成組裝。
隨著這項技術的發(fā)展,生產(chǎn)幾種蛋白質(zhì)藥物的諾和諾德(Novo Nordisk)對與Pentelute的實驗室合作以合成更長的肽和蛋白質(zhì)感興趣。為此,研究人員需要提高在鏈中氨基酸之間形成肽鍵的反應效率。對于每個反應,他們以前的效率在95%到98%之間,但是對于更長的蛋白質(zhì),他們需要它在99%以上。
彭特洛特說:“基本原理是,如果我們真的很擅長制造肽,我們可以將技術擴展到制造蛋白質(zhì)。”“我們的想法是擁有一臺機器,用戶可以走到機器上并輸入蛋白質(zhì)序列,然后以有效的方式將這些氨基酸串在一起,最終,您可以得到想要的蛋白質(zhì)“這是非常具有挑戰(zhàn)性的,因為如果每一步的化學反應都不接近100%,您將不會得到任何所需的材料。”
為了提高成功率并找到每種反應的最佳方法,研究人員在許多不同條件下進行了氨基酸特異性偶聯(lián)反應。研究人員說,在這項研究中,他們組裝了一個通用方案,每個反應的平均效率均高于99%,這在將許多氨基酸連接形成大蛋白時產(chǎn)生了顯著差異。
Hartrampf說:“如果您要制造蛋白質(zhì),那么這額外的1%確實可以發(fā)揮作用,因為副產(chǎn)物會累積,并且每個摻入的氨基酸都需要很高的成功率。”
使用這種方法,研究人員能夠合成一種包含164個氨基酸的蛋白質(zhì)-細菌蛋白質(zhì)SortaseA。他們還生產(chǎn)了胰島素原,一種具有86個氨基酸的胰島素前體以及一種名為溶菌酶的酶(其具有129個氨基酸)以及一些其他蛋白質(zhì)。所需的蛋白質(zhì)必須先純化,然后折疊成正確的形狀,這會增加整個合成過程的幾個小時。所有純化的合成蛋白都以毫克量獲得,占總產(chǎn)量的1-5%。
藥物化學
研究人員還測試了其五個合成蛋白的生物學功能,發(fā)現(xiàn)它們與生物學表達的變體具有可比性。
研究人員說,快速產(chǎn)生任何所需蛋白質(zhì)序列的能力應能加快藥物開發(fā)和測試的速度。這項新技術還允許將活細胞DNA編碼的20種氨基酸以外的氨基酸摻入蛋白質(zhì)中,從而大大擴展了可能產(chǎn)生的潛在蛋白質(zhì)藥物的結構和功能多樣性。
尼爾森說:“這為蛋白質(zhì)藥物化學的新領域鋪平了道路。”“這項技術確實補充了制藥業(yè)的現(xiàn)有技術,為迅速發(fā)現(xiàn)基于肽和蛋白質(zhì)的生物制藥提供了新的機會。”
研究人員正在致力于進一步改進該技術,以使其能夠組裝長達300個氨基酸的蛋白質(zhì)鏈。他們還致力于使整個制造過程自動化,以便一旦合成蛋白質(zhì),就無需任何人工干預即可進行切割,純化和折疊步驟。